Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FMODQ06828 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FMODQ06828 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FMODQ06828 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FMODQ06828 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FMODQ06828 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FMODQ06828 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FMODQ06828 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FMODQ06828 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FMODQ06828 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FMODQ06828 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FMODQ06828 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FMODQ06828 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FMODQ06828 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms