Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 POLR1B-217ENST00000541869 5059 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-204ENST00000375290 10631 ntTSL 210.65□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-211ENST00000476493 588 ntTSL 59.54□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ERI1-202ENST00000518663 698 ntTSL 59.45□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ATAT1-208ENST00000468713 1195 ntTSL 39.14□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 TMEM245-202ENST00000413712 1973 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-207ENST00000467652 388 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-214ENST00000492007 817 ntTSL 38.92□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 USP15-213ENST00000549268 1087 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-203ENST00000373506 766 ntTSL 38.71□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 USP15-207ENST00000547317 499 ntTSL 38.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 TIMM17A-203ENST00000482943 2523 ntTSL 28.02□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-215ENST00000498691 541 ntTSL 57.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 KDM4C-209ENST00000489243 1439 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 PTCH1-216ENST00000548379 548 ntTSL 47.03□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ERI1-208ENST00000522612 521 ntTSL 36.14□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-204ENST00000436661 514 ntTSL 1 (best)6.08□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-211ENST00000519415 2476 ntTSL 25.62□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ZBTB8OS-209ENST00000473294 620 ntTSL 55.5□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 ERI1-204ENST00000520332 750 ntTSL 35.04□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 26.8
FMR1Q06787 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)25.15■■□□□ 1.622e-7■■■■□ 26.7
FMR1Q06787 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-7■■■■□ 26.7
FMR1Q06787 DAXX-207ENST00000468536 817 ntTSL 218.1■□□□□ 0.493e-8■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-8■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.073e-8■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-8■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-8■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 DAXX-208ENST00000477162 847 ntTSL 59.98□□□□□ -0.813e-8■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.559e-8■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 ANKRD17-210ENST00000561029 2717 ntTSL 524.9■■□□□ 1.588e-7■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.228e-7■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.438e-7■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.328e-7■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.43□□□□□ -1.388e-7■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 26.6
FMR1Q06787 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.361e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 DDB1-207ENST00000535967 1404 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 TPR-202ENST00000451586 515 ntTSL 229.65■■■□□ 2.345e-11■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.765e-11■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.595e-11■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.211e-26■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 21e-26■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 PRELID1-205ENST00000504594 886 ntTSL 323.11■■□□□ 1.291e-26■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 CTNNA1-231ENST00000521941 224 ntTSL 310.4□□□□□ -0.741e-18■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 26.5
FMR1Q06787 NBAS-202ENST00000417461 1330 ntTSL 221.3■■□□□ 18e-7■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.136e-8■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 510.28□□□□□ -0.766e-8■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 LTBP4-217ENST00000597151 285 ntTSL 219.65■□□□□ 0.746e-11■■■■□ 26.4
FMR1Q06787 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.35e-16■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-16■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 NUP214-207ENST00000476004 502 ntTSL 319.62■□□□□ 0.732e-10■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 XPO6-202ENST00000561488 638 ntTSL 219.37■□□□□ 0.691e-8■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 XPO6-217ENST00000569973 544 ntTSL 419.18■□□□□ 0.661e-8■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 MCM2-203ENST00000468659 557 ntTSL 426.84■■□□□ 1.892e-7■■■■□ 26.3
FMR1Q06787 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 26.2
FMR1Q06787 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 26.2
FMR1Q06787 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.196e-9■■■■□ 26.2
FMR1Q06787 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.056e-9■■■■□ 26.2
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 71.6 ms