Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABPAQ06546 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms