Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
REG3AQ06141 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms