Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB3Q05901 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms