Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RELQ04864 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RELQ04864 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RELQ04864 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RELQ04864 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RELQ04864 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RELQ04864 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RELQ04864 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RELQ04864 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RELQ04864 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RELQ04864 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RELQ04864 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RELQ04864 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RELQ04864 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RELQ04864 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RELQ04864 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RELQ04864 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RELQ04864 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RELQ04864 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RELQ04864 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RELQ04864 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RELQ04864 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RELQ04864 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RELQ04864 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms