Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX1Q04741 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EMX1Q04741 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms