Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms