Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRG1Q02297 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms