Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1BQ00975 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1BQ00975 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms