Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSG4Q00888 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSG4Q00888 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms