Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIM1P81133 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIM1P81133 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIM1P81133 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIM1P81133 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIM1P81133 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIM1P81133 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIM1P81133 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIM1P81133 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIM1P81133 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms