Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB2P80303 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms