Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC5P78333 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC5P78333 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC5P78333 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC5P78333 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC5P78333 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC5P78333 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC5P78333 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC5P78333 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC5P78333 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC5P78333 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC5P78333 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC5P78333 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC5P78333 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC5P78333 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC5P78333 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC5P78333 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC5P78333 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms