Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms