Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2LP62875 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms