Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPD1P62314 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPD1P62314 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms