Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMO4P61968 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMO4P61968 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMO4P61968 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMO4P61968 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMO4P61968 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO4P61968 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO4P61968 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms