Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms