Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVFC1-1P60608 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms