Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN2P57739 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN2P57739 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN2P57739 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms