Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCBP4P57723 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCBP4P57723 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms