Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMIN4P57678 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEMIN4P57678 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMIN4P57678 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMIN4P57678 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMIN4P57678 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMIN4P57678 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEMIN4P57678 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms