Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RWDD2BP57060 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms