Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GSCP56915 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSCP56915 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSCP56915 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSCP56915 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSCP56915 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSCP56915 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSCP56915 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSCP56915 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSCP56915 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSCP56915 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSCP56915 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GSCP56915 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSCP56915 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSCP56915 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSCP56915 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSCP56915 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSCP56915 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GSCP56915 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSCP56915 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms