Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE2P56282 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE2P56282 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE2P56282 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE2P56282 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE2P56282 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE2P56282 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE2P56282 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE2P56282 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE2P56282 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE2P56282 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE2P56282 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE2P56282 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms