Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUMO3P55854 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMO3P55854 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMO3P55854 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms