Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAPAP54920 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAPAP54920 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAPAP54920 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAPAP54920 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAPAP54920 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAPAP54920 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAPAP54920 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAPAP54920 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAPAP54920 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAPAP54920 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAPAP54920 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAPAP54920 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAPAP54920 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAPAP54920 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAPAP54920 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAPAP54920 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAPAP54920 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAPAP54920 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NAPAP54920 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAPAP54920 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NAPAP54920 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAPAP54920 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms