Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2A2P52657 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2A2P52657 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms