Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC3P51654 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC3P51654 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC3P51654 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC3P51654 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC3P51654 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC3P51654 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC3P51654 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC3P51654 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC3P51654 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC3P51654 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC3P51654 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC3P51654 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC3P51654 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC3P51654 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC3P51654 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms