Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETV1P50549 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETV1P50549 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETV1P50549 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ETV1P50549 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ETV1P50549 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ETV1P50549 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ETV1P50549 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ETV1P50549 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ETV1P50549 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ETV1P50549 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ETV1P50549 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ETV1P50549 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ETV1P50549 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ETV1P50549 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ETV1P50549 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ETV1P50549 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms