Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGS4P49798 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGS4P49798 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGS4P49798 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGS4P49798 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGS4P49798 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGS4P49798 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGS4P49798 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGS4P49798 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGS4P49798 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGS4P49798 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGS4P49798 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGS4P49798 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGS4P49798 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms