Protein–RNA interactions for Protein: P49748

ACADVL, Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADVLP49748 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACADVLP49748 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADVLP49748 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADVLP49748 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADVLP49748 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADVLP49748 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADVLP49748 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADVLP49748 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADVLP49748 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADVLP49748 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms