Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD97P48960 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD97P48960 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD97P48960 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD97P48960 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD97P48960 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD97P48960 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD97P48960 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD97P48960 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD97P48960 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD97P48960 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD97P48960 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD97P48960 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD97P48960 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD97P48960 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD97P48960 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD97P48960 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD97P48960 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD97P48960 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD97P48960 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD97P48960 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD97P48960 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD97P48960 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD97P48960 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms