Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ1P48048 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ1P48048 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ1P48048 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms