Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL29P47914 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL29P47914 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL29P47914 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL29P47914 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL29P47914 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL29P47914 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL29P47914 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL29P47914 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL29P47914 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL29P47914 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL29P47914 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL29P47914 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL29P47914 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL29P47914 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms