Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGRP47804 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RGRP47804 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RGRP47804 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGRP47804 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RGRP47804 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGRP47804 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGRP47804 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGRP47804 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RGRP47804 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGRP47804 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGRP47804 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGRP47804 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGRP47804 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms