Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTRNP46939 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UTRNP46939 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UTRNP46939 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UTRNP46939 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UTRNP46939 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UTRNP46939 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UTRNP46939 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTRNP46939 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTRNP46939 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UTRNP46939 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UTRNP46939 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UTRNP46939 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UTRNP46939 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UTRNP46939 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UTRNP46939 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UTRNP46939 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UTRNP46939 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UTRNP46939 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UTRNP46939 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UTRNP46939 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTRNP46939 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTRNP46939 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTRNP46939 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTRNP46939 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTRNP46939 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTRNP46939 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTRNP46939 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTRNP46939 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTRNP46939 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTRNP46939 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTRNP46939 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTRNP46939 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTRNP46939 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTRNP46939 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTRNP46939 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTRNP46939 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTRNP46939 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UTRNP46939 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms