Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPD2P43304 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD2P43304 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD2P43304 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD2P43304 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD2P43304 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD2P43304 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD2P43304 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD2P43304 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD2P43304 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD2P43304 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD2P43304 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD2P43304 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD2P43304 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD2P43304 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD2P43304 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms