Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRATP43155 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRATP43155 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRATP43155 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRATP43155 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRATP43155 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRATP43155 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRATP43155 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CRATP43155 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRATP43155 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRATP43155 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRATP43155 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRATP43155 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRATP43155 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRATP43155 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRATP43155 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRATP43155 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRATP43155 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRATP43155 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRATP43155 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRATP43155 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRATP43155 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRATP43155 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRATP43155 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms