Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL13AP40429 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms