Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGHMBP2P38935 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGHMBP2P38935 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms