Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1AP37088 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1AP37088 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms