Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6V1E1P36543 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms