Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM23P36406 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM23P36406 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms