Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHI3L1P36222 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHI3L1P36222 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms