Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT9P35527 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT9P35527 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT9P35527 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT9P35527 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT9P35527 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT9P35527 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT9P35527 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT9P35527 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT9P35527 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT9P35527 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT9P35527 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT9P35527 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT9P35527 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT9P35527 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT9P35527 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT9P35527 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT9P35527 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT9P35527 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT9P35527 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT9P35527 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT9P35527 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT9P35527 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT9P35527 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT9P35527 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT9P35527 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT9P35527 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT9P35527 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms