Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA7P31268 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms