Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPOP30536 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPOP30536 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPOP30536 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPOP30536 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPOP30536 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSPOP30536 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms