Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBRP28336 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMBRP28336 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBRP28336 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBRP28336 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBRP28336 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBRP28336 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBRP28336 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBRP28336 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBRP28336 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBRP28336 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBRP28336 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBRP28336 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBRP28336 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMBRP28336 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMBRP28336 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMBRP28336 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMBRP28336 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NMBRP28336 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBRP28336 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBRP28336 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBRP28336 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBRP28336 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBRP28336 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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